Новый штамм коронавируса, или Как ковид начал «FLiRTовать»

В марте этого года мир узнал об очередном штамме коронавируса с романтическим названием FLiRT. Он потомок штамма JN.1 – подвида известного «Омикрон». Какова ситуация с FLiRT, и эффективны ли против него имеющиеся вакцины?

Откуда взялся FLiRT?

Точное происхождение нового штамма коронавируса FLiRT до сих пор остается загадкой⁽¹⁾. Первые упоминания о нем появились в США, где он был обнаружен в образцах сточных вод в ходе исследований, проводимых Центром по контролю и профилактике заболеваний (CDC). Благодаря анализу сточных вод можно отследить наличие следов вируса SARS-CoV-2 в некоторых сообществах, даже если у людей нет симптомов. Такой подход позволяет специалистам своевременно предупреждать о возможных всплесках заболеваемости COVID-19. С тех пор варианты FLiRT были обнаружены в ряде других стран, в частности в Канаде и Великобритании, а также в ряде европейских стран.

Чтобы лучше понять, как возникли варианты FLiRT, следует взглянуть на то, как с течением времени изменялся сам вирус SARS-CoV-2. Понятно, что в процессе его эволюции возникают новейшие варианты вследствие мутаций в генетическом коде вируса. К примеру, «Омикрон» стал одним из таких вариантов SARS-CoV-2, который начал доминировать в 2021 году. Со временем «Омикрон» дал начало нескольким подвариантам, одним из которых стал штамм JN.1, обнаруженный в сентябре 2023 года. Он быстро распространился по США, вызвав очередную волну госпитализаций. Именно JN.1 является предшественником FLiRT, поскольку FLiRT происходит от одного из его подвидов под названием JN.1.11.1.

Кроме того, еще одним вариантом JN.1 является LB.1, который до сих пор активно изучается учеными. Некоторые мутации в генетическом коде LB.1 могут отличать его от FLiRT, также интересующего исследователей.

Новая группа вариантов вируса FLiRT стала еще одним подвидом Омикрона. По словам специалистов, этот штамм мог возникнуть из-за комбинации нескольких подвидов «Омикрона». Название FLiRT происходит от названия мутаций в генетическом коде вируса, которые идентифицируют эти варианты. F456L, V1104L и R346T.

По состоянию на середину 2024 г. штамм FLiRT активно распространяется в США, где его подвиды KS.1, KP.1.1 и KP.2 фиксируются в значительном количестве случаев заболевания. Наиболее распространенным вариантом является KP.2, на который в марте 2024 года приходилось 28,2 % от всех новых случаев инфицирования в США. Однако варианты FLiRT уже обнаружены не только в Северной Америке – он активно распространяется по миру, в том числе и по Украине. Летом этого года заболеваемость ководом выросла почти в 13 раз. Посреди случаев фиксируется и новый штамм FLiRT.

Интересно, что в США активно распространяется один из потомков FLiRT – вариант KP.3.1.1. По данным CDC, этот штамм выявляют у 37% образцов, полученных от пациентов. Итак, вполне вероятно, что совсем скоро мы услышим о новом подвиде коронавируса.

Насколько опасны новые штаммы коронавируса?

Новые варианты коронавируса вызывают беспокойство среди ученых и врачей из-за возможных изменений в течении болезни и ее последствиях для здоровья людей. Как и все мутации SARS-CoV-2, новые штаммы могут иметь определенные преимущества в распространении и усложнять борьбу с пандемией, особенно если они влияют на эффективность иммунного ответа. На данный момент нет достаточного количества данных для того, чтобы утверждать, что FLiRT вызывает более тяжелые случаи COVID-19, чем другие штаммы.

Штамм KP.3.1.1 имеет дополнительные мутации в своей структуре, которые могут повлиять на его способность обходить иммунную защиту, сформированную после вакцинации или перенесенного заболевания. Ученые исследовают, действительно ли эти мутации могут повысить его устойчивость к антителам или уменьшить эффективность существующих методов лечения. Первые данные свидетельствуют, что KP.3.1.1 может иметь повышенную передачу способности по сравнению с предыдущими вариантами. Исследование, опубликованное в журнале The Lancet, демонстрирует, что KP.3.1.1 имеет в 1,2 раза выше относительный коэффициент репродукции (Re) по сравнению с другими подвариантами JN.1, такими как KP.2 и LB.1⁽²⁾. Это означает, что он может распространяться быстрее, чем уже наблюдаемые в ряде стран предыдущие варианты.

Несмотря на то, что новые штаммы коронавируса, такие как FLiRT и KP.3.1.1, продолжают распространяться, они пока не демонстрируют значительно большей тяжести заболевания.

Почему возникают новые штаммы?

Новые штаммы коронавируса возникают из-за естественного процесса эволюции вирусов, в частности SARS-CoV-2. Этот процесс обусловлен способностью вируса к мутациям – изменениям в его генетическом коде, которые могут происходить при копировании в инфицированных клетках. В случае SARS-CoV-2, являющегося РНК-вирусом, мутации происходят относительно часто, что приводит к появлению новых вариантов.

Вирус пытается адаптироваться к условиям, в которых он распространяется и мутации могут улучшить его выживание. Например, некоторые изменения позволяют вирусу легче инфицировать клетки, эффективнее передаваться между людьми или избегать формируемого после инфекции или вакцинации иммунного ответа. Такие мутации могут стать ключевыми для дальнейшего доминирования новых штаммов.

Еще одной важной причиной появления новых вариантов является массовое распространение вируса среди множества людей. Чем больше людей инфицированы, тем больше шансов для вируса мутировать. Кроме того, в разных регионах мира могут возникать специфические условия появления определенных мутаций, что приводит к образованию локальных штаммов.

Одним из важнейших факторов, способствующих быстрому распространению новых вариантов, является селекционное давление. Это явление возникает, когда иммунная система человека или лекарства создают среду, в которой выживают только те варианты вируса, которые обладают способностью избегать защитных механизмов. Например, после широкомасштабной вакцинации могут появиться варианты, менее восприимчивые к нейтрализации антителами, сформированными после вакцинирования.

Кроме природного отбора, существует и фактор международных путешествий и глобализации. Из-за высокой мобильности населения новые штаммы быстро распространяются между странами, что создает условия для дальнейших мутаций и создания новых подвидов.

Эффективны ли вакцины против новых штаммов?

Имеющиеся вакцины против COVID-19, разработанные на основе первичных штаммов вируса, продолжают предоставлять определенный уровень защиты от новых вариантов коронавируса, включая FLiRT и KP.3.1.1. Однако из-за постоянных мутации вируса эффективность этих вакцин может несколько снижаться.

Мутации, в частности в шиповом белке, являющемся ключевой мишенью для вакцин, могут помогать новым штаммам обходить иммунный ответ организма. Исследования показывают, что KP.3.1.1 демонстрирует более высокую способность к иммунному побегу по сравнению с предыдущими вариантами (2).

Вакцинация продолжает быть эффективной против предыдущих штаммов, таких как JN.1 и его производных. Обновленные бустерные дозы, разработанные для борьбы с вариантами «Омикрона», могут обеспечить лучшую защиту против новых штаммов FLiRT и KP.3.1.1, хотя эффективность может быть несколько ниже, чем ранее доминирующих вариантов.

Ученые продолжают работать над обновлением вакцин, чтобы сделать их более эффективными против новых вариантов коронавируса. Важной стратегией является адаптация вакцин к новым мутациям вируса и регулярное обновление бустерных доз для поддержания должного уровня иммунитета у населения.